Na današnji dan 1949. osnovana je Viša pomorska škola u Rijeci koja se kasnije razvila u fakultet koji djeluje i danas.
Povijest pomorskog obrazovanja u Rijeci seže u 1866. godinu, kada je u zgradi gradske bolnice započela s radom Austro-Ugarska Vojno-pomorska akademija. Riječ je bila o najvažnijoj ustanovi za školovanje pomorskih časnika u tadašnjoj Monarhiji. Od 1889. djeluje pod nazivom carsko-kraljevska Vojno-pomorska akademija (Marine Akademie), a četverogodišnje školovanje pohađali su polaznici iz svih krajeva države. Među njima su bili i istaknuti hrvatski pomorski časnici, poput admirala Maksimilijana Njegovana te Janka pl. Vukovića-Podkapelskog, kasnijeg prvog zapovjednika mornarice Države Slovenaca, Hrvata i Srba.
Rad Akademije prekinut je početkom Prvog svjetskog rata, kada je premještena u Beč. Do 1918. zgrada u Rijeci služila je kao poljska bolnica, a nakon raspada Austro-Ugarske postaje glavna gradska bolnica, čime je prekinut dugogodišnji kontinuitet visokog pomorskog obrazovanja u gradu. Novo poglavlje započinje 4. travnja 1949. godine, kada je uredbom Vlade FNRJ osnovana Viša pomorska škola, čime se Rijeka ponovno afirmira kao važno središte pomorskog obrazovanja, a škola ubrzo postaje ključna za obrazovanje pomoraca, brodostrojara i drugih stručnjaka.
Institucija se tijekom desetljeća razvijala i širila. Godine 1978. prerasta u Fakultet za pomorstvo i saobraćaj, čime se uvode novi studijski programi, uključujući pomorski transport i logistiku. Krajem 1990-ih dolazi do reorganizacije pa se 1998. osnivaju dvije zasebne ustanove: Visoka pomorska škola u Rijeci i Odjel za pomorstvo Sveučilišta u Rijeci. Daljnji iskorak napravljen je 2001. godine, kada Ministarstvo znanosti i tehnologije Republike Hrvatske donosi odluku o njihovom objedinjavanju u Pomorski fakultet Sveučilišta u Rijeci. Time su objedinjeni resursi i stručnost, što je omogućilo daljnji razvoj ustanove koja danas ima važnu ulogu u obrazovanju, znanstvenom radu i suradnji s pomorskom industrijom.
